• facebook
  • linkedin
  • youtube

Sê tîpên SNP di lêkolîna genetîka nifûsê de berbelav in.Tevî lêkolîna nexweşiya mirovan, pozîsyona taybetmendiya çandiniyê, pêşkeftina heywanan û ekolojiya molekular, SNP wekî bingeh hewce ne.Lêbelê, heke hûn têgihiştinek kûr a genetîka nûjen a ku li ser bingeha rêzgirtina berbelav-bilind e, û li hember van sê tîpan nebin, ew "xerîbê herî naskirî" xuya dike, wê hingê hûn nekarin lêkolîna paşîn pêk bînin.Ji ber vê yekê berî ku em dest bi lêkolîna şopandinê bikin, bila em mêze bikin ka SNP çi ye.

SNP (polîmorfîzma yek nucleotide), em dikarin ji navê wê yê tevahî îngilîzî bibînin, ew guhertoya yek nucleotide an pirmorfîzmê vedibêje.Di heman demê de navek veqetandî jî heye, ku jê re SNV (guhertoya yek nucleotide) tê gotin.Di hin lêkolînên mirovî de, tenê yên ku bi frekansa nifûsê ji% 1-ê bilindtir in, jê re SNP têne gotin, lê bi gelemperî, her du dikarin werin tevlihev kirin.Ji ber vê yekê em dikarin bibêjin ku SNP, pirmorfîzma yek nucleotide, mutasyona ku di genomê de yek nukleotîd bi nukleotîdek din tê veguheztin, vedibêje.Mînakî, di jimareya jêrîn de, cotek bingehek AT bi cotek bingehek GC, ku malperek SNP-ê ye, tê guheztin.

Sûret

Genetîk 1

Lêbelê, gelo ew "polimorfîzma yek nucleotide" be an "guheztinek yek nucleotide" be, ew bi relatîfî tê axaftin, ji ber vê yekê daneyên SNP-ê wekî bingeh ji nûvekirina genomê re hewce dike, ango, daneyên rêzkirinê piştî rêzkirina genoma kesane têne rêz kirin.Li gorî genomê, cîhê ku ji genomê cûda dibe wekî malperek SNP tê dîtin.

Di warê SNP-ên li ser sebzeyan de,kit Plant Direct PCRdikare ji bo tespîtkirina bilez were bikar anîn.

Di warê celebên mutasyonê de, SNP veguherîn û veguherînê vedigire.Veguheztin li şûna purines bi purine an pyrimidines bi pyrimidines re vedibêje.Veguheztin bi veguheztina hevbeş a di navbera purine û pyrimidines de vedibêje.Frekansa rûdanê dê cûda be, û îhtîmala derbasbûnê dê ji ya veguheztinê mezintir be.

Di warê cihê ku SNP çêdibe, SNP-ên cihêreng dê bandorên cûda li ser genomê bikin.SNP-yên ku li herêma navjenî, ango herêma di navbera genên li ser genomê de çêdibin, dibe ku bandorê li fonksiyona genomê nekin, û mutasyonên di întron an jî li herêma pêşverû ya jorîn a genê de dibe ku bandorek diyar li ser genê hebe;Mutasyonên ku li herêmên exon ên genan çêdibin, li gorî ka ew dibin sedema guhertinên di asîdên amînî yên kodkirî de, bandorên cûda li ser fonksiyonên genan dikin.(Bê guman, her çend du SNP di asîdên amînoyî de bibin sedema cûdahiyan, ew bandorên cûda li ser avahiya proteînê hene, û di dawiyê de bandorên li ser fenotîpa biyolojîkî dibe ku pir cûda bin).

Lêbelê, hejmara SNP-yên ku li cîhên genê çêdibin bi gelemperî ji ya cîhên ne-genê pir kêmtir e, ji ber ku SNP-ya ku bandorê li fonksiyona genê dike bi gelemperî bandorek neyînî li ser zindîbûna kesan dike, di encamê de kesê ku vê SNP-ê di komê de hilgirtiye Di nav wan de ji holê rabû.

Bê guman, ji bo organîzmayên diploîd, kromozom bi cot hene, lê ne mimkûn e ku cotek kromozom ji bo her bingehek tam wek hev bin.Ji ber vê yekê, hin SNP jî dê heterozîgot xuya bibin, ango li ser vê pozîsyonê li ser kromozomê du bingeh hene.Di komekê de, jenotîpên SNP yên kesên cihêreng bi hev re têne berhev kirin, ku ev dibe bingehek ji bo piraniya analîzên paşîn.Bi tevhevbûna taybetmendiyan re, meriv dikare were darizandin ka SNP wekî nîşankerek molekulî bi taybetmendiyan ve girêdayî ye, QTL (cihê taybetmendiya mîqdar) ya taybetmendiyê dikare were darizandin, û GWAS (lêkolîna komeleya berfireh a genomê) an çêkirina nexşeya genetîkî dikare were kirin;SNP dikare wekî nîşankerek molekulî were bikar anîn Dadwerê têkiliya pêşveçûnê ya di navbera kesan de;hûn dikarin SNP-ên fonksiyonel bişopînin û mutasyonên têkildarî nexweşiyê bixwînin;hûn dikarin guheztinên frekansa alelên SNP an rêjeyên heterozîgotî û nîşankerên din bikar bînin da ku deverên hilbijartî li ser genomê diyar bikin... hwd., bi hev re bi hev re Bi pêşkeftina rêziknameya bilind-rêveberê, bi sed hezaran an bêtir malperên SNP dikarin ji komek daneyên rêzkirinê werin wergirtin.Dikare were gotin ku SNP êdî bûye bingehê lêkolîna genetîkî ya nifûsê.

Bê guman, guhertinên di bingehên di genomê de ne her gav şûna bingehek bi bingehek din re ne (her çend ev yeka herî gelemperî ye).Her weha dibe ku yek an çend bingehek, an jî du baregeh winda bibin.Çend bingehên din jî di naverastê de hatin bicihkirin.Vê rêza piçûk a lêxistin û jêbirinê bi hev re InDel (navkirin û jêbirin) tê gotin, ku bi taybetî behsa danîn û jêbirina perçeyên kurt (yek an çend bingeh) dike.InDel ku li cîhê genê çêdibe dibe ku bandorek li ser fonksiyona genê jî bike, ji ber vê yekê carinan dibe ku InDel jî di lêkolînê de rolek girîng bilîze.Lê bi giştî, statûya SNP-ê wekî kevirê bingehîn genetîka nifûsê hîn jî nerazî ye.


Dema şandinê: Tebax-27-2021